MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017814	ATT	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858830
2	NC_017814	CAT	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858830
3	NC_017814	CTT	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858830
4	NC_017814	CTT	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858830
5	NC_017814	AGCATT	2	12	854	865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858830
6	NC_017814	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858830
7	NC_017814	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858831
8	NC_017814	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858831
9	NC_017814	CTG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
10	NC_017814	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
11	NC_017814	TCT	2	6	2369	2374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
12	NC_017814	CTA	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
13	NC_017814	ATTT	2	8	2402	2409	25 %	75 %	0 %	0 %	386858832
14	NC_017814	CTT	2	6	2435	2440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
15	NC_017814	C	6	6	2442	2447	0 %	0 %	0 %	100 %	386858832
16	NC_017814	CTG	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
17	NC_017814	CCT	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858832
18	NC_017814	CTG	3	9	2525	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
19	NC_017814	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
20	NC_017814	GTT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858832
21	NC_017814	CAC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858832
22	NC_017814	GCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858832
23	NC_017814	TGT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858832
24	NC_017814	TGC	3	9	2691	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
25	NC_017814	CTG	4	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
26	NC_017814	TTA	2	6	2725	2730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
27	NC_017814	ATA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858832
28	NC_017814	TTA	2	6	2764	2769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
29	NC_017814	CTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
30	NC_017814	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
31	NC_017814	CAT	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
32	NC_017814	TTCC	2	8	2897	2904	0 %	50 %	0 %	50 %	386858832
33	NC_017814	ATT	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
34	NC_017814	CTA	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
35	NC_017814	AGT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858832
36	NC_017814	CTG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
37	NC_017814	TTAT	2	8	3025	3032	25 %	75 %	0 %	0 %	386858832
38	NC_017814	CTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
39	NC_017814	TTC	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
40	NC_017814	TCT	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
41	NC_017814	CTT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
42	NC_017814	CAT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
43	NC_017814	CAT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
44	NC_017814	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
45	NC_017814	T	6	6	3360	3365	0 %	100 %	0 %	0 %	386858832
46	NC_017814	TTC	2	6	3377	3382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
47	NC_017814	ACA	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858833
48	NC_017814	TC	3	6	3616	3621	0 %	50 %	0 %	50 %	386858833
49	NC_017814	TTAT	2	8	3630	3637	25 %	75 %	0 %	0 %	386858833
50	NC_017814	TAC	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
51	NC_017814	CAT	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
52	NC_017814	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858833
53	NC_017814	CTG	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858833
54	NC_017814	TCTT	2	8	3816	3823	0 %	75 %	0 %	25 %	386858833
55	NC_017814	TAT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858833
56	NC_017814	T	6	6	3857	3862	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
57	NC_017814	CAG	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858833
58	NC_017814	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
59	NC_017814	CAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
60	NC_017814	AGC	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858833
61	NC_017814	TCA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
62	NC_017814	TGC	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858833
63	NC_017814	CAT	2	6	4012	4017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
64	NC_017814	T	8	8	4046	4053	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
65	NC_017814	AGT	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858833
66	NC_017814	CAC	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858833
67	NC_017814	ATCTT	2	10	4200	4209	20 %	60 %	0 %	20 %	386858833
68	NC_017814	CTT	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
69	NC_017814	CTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
70	NC_017814	CTTA	2	8	4253	4260	25 %	50 %	0 %	25 %	386858833
71	NC_017814	CTT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
72	NC_017814	ATC	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
73	NC_017814	ACC	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858833
74	NC_017814	TAC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
75	NC_017814	T	6	6	4595	4600	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
76	NC_017814	TTC	2	6	4612	4617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
77	NC_017814	TCTTT	2	10	4863	4872	0 %	80 %	0 %	20 %	386858834
78	NC_017814	T	6	6	4876	4881	0 %	100 %	0 %	0 %	386858834
79	NC_017814	TCT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858834
80	NC_017814	CTA	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858834
81	NC_017814	TC	3	6	4971	4976	0 %	50 %	0 %	50 %	386858834
82	NC_017814	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858834
83	NC_017814	ACT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858834
84	NC_017814	ATT	2	6	5166	5171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
85	NC_017814	GCT	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858835
86	NC_017814	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
87	NC_017814	CAC	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858835
88	NC_017814	TTA	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
89	NC_017814	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858835
90	NC_017814	ACC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858835
91	NC_017814	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
92	NC_017814	ATT	2	6	5390	5395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
93	NC_017814	CTA	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
94	NC_017814	ATC	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
95	NC_017814	TTC	2	6	5519	5524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858835
96	NC_017814	ACCT	2	8	5537	5544	25 %	25 %	0 %	50 %	386858835
97	NC_017814	T	7	7	5549	5555	0 %	100 %	0 %	0 %	386858835
98	NC_017814	AAT	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858835
99	NC_017814	CTT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858835
100	NC_017814	CT	4	8	5698	5705	0 %	50 %	0 %	50 %	386858835
101	NC_017814	CTC	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858835
102	NC_017814	CAT	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
103	NC_017814	CTC	3	9	5752	5760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858835
104	NC_017814	CAT	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
105	NC_017814	TTTA	2	8	7268	7275	25 %	75 %	0 %	0 %	386858836
106	NC_017814	TAA	2	6	7354	7359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858836
107	NC_017814	TCA	2	6	7361	7366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
108	NC_017814	CTTT	2	8	7434	7441	0 %	75 %	0 %	25 %	386858836
109	NC_017814	ATC	3	9	7444	7452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
110	NC_017814	T	6	6	7462	7467	0 %	100 %	0 %	0 %	386858836
111	NC_017814	TCA	2	6	7475	7480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
112	NC_017814	AAT	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858836
113	NC_017814	TCA	2	6	7544	7549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
114	NC_017814	CTA	2	6	7614	7619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
115	NC_017814	ATT	2	6	7633	7638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858836
116	NC_017814	CTT	2	6	7672	7677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858836
117	NC_017814	TTC	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858836
118	NC_017814	TCA	2	6	7706	7711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
119	NC_017814	TCT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858836
120	NC_017814	CCTT	2	8	7815	7822	0 %	50 %	0 %	50 %	386858836
121	NC_017814	TCCT	2	8	7837	7844	0 %	50 %	0 %	50 %	386858836
122	NC_017814	TCC	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858836
123	NC_017814	CAT	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
124	NC_017814	CAC	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858836
125	NC_017814	CAT	3	9	7888	7896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
126	NC_017814	CCTTC	2	10	7909	7918	0 %	40 %	0 %	60 %	386858836
127	NC_017814	CT	3	6	7927	7932	0 %	50 %	0 %	50 %	386858836
128	NC_017814	TC	3	6	7933	7938	0 %	50 %	0 %	50 %	386858836
129	NC_017814	CT	3	6	7939	7944	0 %	50 %	0 %	50 %	386858836
130	NC_017814	TC	3	6	7953	7958	0 %	50 %	0 %	50 %	386858836
131	NC_017814	T	6	6	7966	7971	0 %	100 %	0 %	0 %	386858836
132	NC_017814	TTTC	2	8	7980	7987	0 %	75 %	0 %	25 %	386858836
133	NC_017814	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858837
134	NC_017814	CTA	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858837
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.